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蛋白质习题

蓝月

第三章 蛋白质的空间结构和功能
习题:
3-1.构象(conformation)指的是,一个由多个碳原子组成的分子,因单键的旋转而形成的不同碳原子上各取代基或原子的空间排列,只需单键的旋转即可造成新的构象。多肽链主链在形式上都是单键。因此,可以设想一条多肽主链可能有无限多种构象。然而,一种蛋白质的多肽链在生物体正常的温度和pH下只有一种或很少几种构象,并为生物功能所必需。这种天然的构象是什么样的因素促成的?
3-2.假若一条多肽链完全由丙氨酸构成,什么样的环境促使它很可能形成α–螺旋,是疏水环境还是亲水环境?
3-3.以nm为单位计算α-角蛋白卷曲螺旋(coiled coil)的长度。假定肽链是由100个残基构成。
3-4.一种叫做Schistosoma mansoni 寄生虫的幼虫能感染侵入人的皮肤。这种幼虫分泌出能裂解的-Gly-Pro-X-Y-(X和Y可能是几种氨基酸中的任何一种)顺序中的X和Y之间肽键的酶。为什么该酶活性对这种寄生虫侵入是重要的。
3-5.①是Trp还是Gln更有可能出现在蛋白质分子表面?②是Ser还是Val更有可能出现在蛋白质分子的内部?③是Leu还是Ile更少可能出现在α-螺旋的中间?④是Cys还是Ser更有可能出现在β-折叠中?
3-6.下面的多肽哪种最有可能形成α-螺旋?哪种多肽最难以形成β-折叠?
①CRAGNRKIVLETY;②SEDNFGAPKSILW;③QKASVEMAVRNSG
3-7.胰岛素是由A、B两条链组成的,两条肽通过二硫键连接。在变性条件下使二硫
键还原,胰岛索的活性完全丧失。当巯基被重新氧化后,胰岛素恢复的活性不到天然活性的10%请予以解释。
3-8.对于密度均一的球状蛋白质来说,①随着蛋白质分子增大,其表面积/体积(A/V)的比例是增大还是减小?②随着蛋白质分子增大,其亲水侧链氨基酸残基与疏水侧链氨基酸残基的比例是增大还是减小?
3-9.胎儿血红蛋白(Hb F)在相当于成年人血红蛋白(Hb A)β链143残基位置含有Ser,而成年人β链的这个位置是具阳离子的His残基。残基143面向β亚基之间的中央空隙。①为什么2,3-二磷酸甘油酸(2,3-BPG)同脱氧Hb A的结合比同脱氧Hb F更紧?②Hb F对2,3-BPG的低亲和力如何影响到Hb F对氧的亲和力?③Hb F的P50是18托(torr),Hb A的P50是26托。基于这两个数值如何解释氧从母亲血液有效转运到胎儿。
3-10.在生理条件下,多聚赖氨酸呈随机卷曲的构象。在什么条件下它可以形成α-螺旋?
3-11.某蛋白质用凝胶过滤法测定的表观分子量是90kD;用SDS-PAGE测定时,它的表观分子量是60kD,无论2-巯基乙醇是否存在。哪种测定方法更准确?为什么?
3-12.请根据下面的信息确定蛋白质的亚基组成:① 用凝胶过滤测定,分子量是200kD;②用SDS-PAGE测定,分子量是100kD;③在2-巯基乙醇存在下用SDS-PAGE测定,分子量是40kD和60kD。
3-13.每分子人细胞色素c含有18分子的赖氨酸。100克细胞色素c完全水解得到18.7
克的赖氨酸。求细胞色c的分子量。
3-15.一种纯净的蛋白质样品用普通的聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)在pH8.2条件下进行分析鉴定,得到如图2–7(A)的结果。该蛋白质样品在用SDS处理后,接着用SDS-PAGE进行分析,得到如图2–7(B)的结果。通过对上述两种电泳结果的比较,关于该蛋白质的结构你将得出什么样的结论?该蛋白质的等电点是低于pH8.2还是高于pH8.2?
3-16.一个蛋白质混合物含有下面几种不同的组分:
a Mr=12,000 pI=10; b Mr=62,000 pI=4
c Mr=28,000 pI=7; d Mr=9,000 pI=5
不考虑其他因素,分别指出在下述情况下被洗脱的顺序。
①该混合物用DEAE-纤维素柱层折时,以逐渐增高洗脱液的盐浓度方式进行洗脱。
②该混合物用SephadexG-50凝胶柱层析分析。

2004-5-20 13:08:24



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